微流控黑科技:一滴液滴,守住微藻生物多样性

  一项发表在《ScientificReports》的最新研究,这是将油包水微流控液滴(WODL)技术用于天然微藻的高通量筛选。研究通过模拟藻群与自然海域藻群对照的实验,证实液滴培养可显著维持微藻物种多样性,为微藻资源开发、工业菌株筛选提供全新技术路径。

研究背景

微藻是当下极具潜力的生物资源,不仅能产出脂质、类胡萝卜素等高价值物质,固碳效率更是陆地植物的10—50倍,在碳中和、水产养殖、环境修复等领域都有重要作用。但想要从自然环境中高效筛选出优质微藻菌株,传统方法一直存在明显短板。琼脂平板培养耗时长达1—2个月,只适用于少数能形成菌落的物种;梯度稀释法很难捕获稀有藻种;移液枪分离精度高但通量太低,无法规模化;流式分选则容易因高压、激光损伤细胞,导致培养成功率偏低。

更关键的问题是,传统批量混合培养会出现严重的“优胜劣汰”。快速生长的藻种会抢占营养、抑制其他物种,最终导致大量慢速生长、低丰度的珍贵藻种消失,群落多样性大幅丢失。

 

核心发现

多种形态微藻可在1nL油包水液滴中正常增殖,生长水平与常规培养相当或更优。液滴的物理隔离可消除种间竞争,显著抑制优势藻种过度扩张,更好保留原始群落结构。无论是人工模拟群落,还是自然海域野外群落,液滴培养的物种丰富度、均匀度、多样性指数均显著优于常规批量培养。该技术可实现单细胞封装—培养—筛选一体化,通量达每分钟10万级,适配难培养、不成菌落、低丰度微藻。

 

研究分析

研究设置两组对照:人工构建的模拟微藻群落、取自日本五所湾的自然野外群落,分别进行液滴培养与常规批量培养,并以初始样本为参照。

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以四膜藻(Tetraselmistetrathele)为七种微藻的代表的叠加荧光图像,在(a)0小时和(b)96小时封装在液滴中。比例尺:200μm。模拟群落在96小时的明场图像(c,d)液滴样品和(e)常规培养样品。比例尺:100μm。

 

在模拟群落中,常规培养下硅藻快速占据绝对优势,占比超90%,其他藻种被严重压制;液滴组中各物种比例均衡,多样性稳定保持。在野外自然样本中,常规培养后可检测属数仅11–13个,而液滴培养检出22–26个属,约为批量组的1.9倍,Chao1、Shannon等多样性指标显著更高。机制上,液滴实现单细胞独立培养,阻断营养竞争与化感抑制,让弱势、慢速、稀有藻种得以存活,从而最大程度还原自然群落组成。

  研究结论

本研究首次证实,油包水微流控液滴系统可用于天然微藻的高通量筛选,并在保护物种多样性上显著优于传统方法。该技术兼具高通量、高兼容性、高保真性三大优势,能覆盖传统方法难以获取的稀有与难培养藻种,缩短筛选周期、提升筛选成功率。

研究为微藻种质资源挖掘、工业高产藻株选育、生态环境监测提供了底层技术支撑,推动微藻生物技术向高效、精准、规模化方向升级,助力碳中和与生物制造产业发展。

 

文章链接:Microfluidic droplet cultivation preserves microalgae diversity in screening systems | Scientific Reports

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